中藥材進境時，申報為“藥用”的中藥材，應列入《中華藥典》藥材目錄的物品。
海關按照《進出境中藥材檢疫監督管理辦法》進行檢疫及監督管理。
申報為“食用”的中藥材，即“藥食同源，既是藥品又是食品的物品”(參見“《關于規范食品原料管理的通知》(衛法監發[2002]51號)既是食品又是藥品的物品名單”)，其檢驗、檢疫及監督管理按照有關進出口食品的規定執行。
中藥材進口報關手續：
1、中藥材進口是需要有進出口權；
2、中藥材或中藥飲片的經營范圍；
3、《藥品生產許可證》或《藥品經營許可證》；
4、海關無紙化簽約、海關企業年報申報、電子申報委托協議（進口辦理）；
5、《進境中藥材指定存放、加工企業備案》（如是動物源性中藥材）。
中藥材進口操作流程：
1、中藥材發貨，辦理好收發貨人備案、中文標簽以及國外單證；
2、中藥材到港后，換取小提單（換單）；
3、中藥材報檢（報檢過程需要審核中文標簽是否符合規定，備案標簽）；
4、中藥材報關（海關電子審單、人工審單、海關審價、繳稅、查驗、放行）；
5、將中藥材運至商檢倉庫，拆箱后，預約商檢局抽樣化驗；
6、抽樣化驗合格后，貼上中文標簽（倉庫人員貼）；
7、商檢局人員檢查標簽無誤，放行；
8、將貨物送到您的地點；
9、商檢部門出衛生證。
中藥材出口報關要提交哪些資料？
出境中藥材的貨主或者其代理人應當向中藥材生產企業所在地海關申報，申報時，需如實申報產品的預期用途，并提交以下材料：
1、合同、裝箱單；
2、生產企業出具的出廠合格證明；
3、產品符合進境或者地區動植物檢疫要求的書面聲明。
中藥材進口報關注意事項
對有下列情形之一的進口中藥材，口岸藥品檢驗所不予抽樣：
（一）未提供出廠檢驗報告書和原產地證明原件，或者所提供的原件與申報進口備案時的復印件不符的；
（二）裝運嘜頭與單證不符的；
（三）進口藥品批號或者數量與單證不符的；
（四）進口藥品包裝及標簽與單證不符的；
（五）其他不符合藥品監督管理法律、法規和規章規定的。
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